Após o tratamento biológico, o esgoto passa pelo tratamento físico químico. Na coagulação, são adicionados coagulantes (PAC e polímero catiônico) que formam espécies hidrolisadas com carga superficial positiva, as quais atraem as impurezas do esgoto com carga superficial negativa, formando flocos. Esses flocos passam pela fase denominada floculação para que o tamanho do floco seja apropriado para a flotação por ar dissolvido – FAD. Na FAD, bolhas de gás aderem aos flocos formando agregados estáveis floco/bolha que sobem até a superfície do flotador devido à alta força de empuxo. Na superfície do flotador forma-se grande quantidade de lodo. Um raspador gira em torno do flotador retirando o lodo formado.

Nessa fase (tratamento físico-químico), são removidos DBO, DQO, Sólidos Suspensos Totais, fósforo, óleos e graxas, alguns metais e alguns patogênicos. O efluente clarificado atende ao Decreto 8468/76 e é descartado no Ribeirão Monjolinho, classe IV, segundo classificação do CONAMA 357/05.